El Dr. Mikao Usui, japonés y educador cristiano, quién formaba parte del seminario cristiano en Kyoto, Japón, fue quién redescubrió el sistema Reiki a fines de 1800. Respondiendo al reto de un alumno , después de escuchar hablar de curaciones milagrosas, Usui comenzó un extenso estudio por 21 años sobre el fenómeno de curación energética practicado por los más Grandes Maestros Espirituales de la Historia. Es así como viajó a los Estados Unidos a fin de estudiar en la Universidad de Chicago en donde recibió un Doctorado en Teología. Posteriormente, viajo a la India y China para, luego de algunos años de intensos estudios, regresar al Japón para continuar con su búsqueda.

Luego de ingresar a un monasterio Zen cerca de Kyoto, en donde permaneció siete años estudiando antiguos sutras (enseñanzas budistas en sánscrito), descubre símbolos y sílabas de poder antiguos (Mantras) los cuales están ligados directamente al cuerpo humano y al sistema nervioso, cuyo uso activa la Energía Vital Universal para las curaciones.El Dr. Usui pasó por una experiencia metafísica, luego de un ayuno de 21 días, en el Monte Kori-yama donde le fue dado el poder de usar estos símbolos y mantra para curar, así como dar tratamientos y la habilidad de transmitir dicha energía de otros. El llamo a esa clase de curación Reiki y la enseñó a través de todo el Japón’ hasta su muerte en 1893. _ Más adelante él añadió los Principios del Reiki y la idea de que uno necesita recibir una compensación por el tratamiento, lo que implica intercambio de energía.

En la misma época, un avanzado estudiante de Usui, el Dr. Chujiro Hayashi estableció y dirigió una clínica Reiki en Tokyo. Fue el Segundo Gran Maestro después de Usui. El Dr Hayashi añadió las clásicas imposiciones de manos , los tres grados y el proceso de iniciación.

En los años 30 de este siglo, una mujer japonesa-americana gravemente enferma, Hawayo Takata, llegó a Japón a curarse de una serie de dolencias. Luego que la Sra. Takata fuera ayudada y curada a través del tratamiento en la clínica del Dr. Hayashi; pidió que la iniciaran, recibiendo entrenamiento Reiki para luego regresar a su nativo Hawai a fin de difundir el sistema y tratar a todos los que lo necesitaban.

En 1941 Chujiro Hayashi fallece y Hawayo Takata se convirtió en la Tercera Gran Maestra. Ella continuó como sanadora de Reiki pero no comenzó a entrenar ni a iniciar estudiantes sino hasta los años 70.

Asimismo, ella inicio y transmitió sus enseñanzas a su nieta, Phyllis Lei Furumoto, quien se convirtió en la Cuarta Gran Maestra. Ella está a !a cabeza de la Asociación Alianza Reiki (ARA), en Catalgo, Idaho. Esta organización promueve la línea tradicional del Sistema Usui de Curación Natural. Otra organización mundial que promueve el Reiki es la Asociación Americana Internacional de Reiki (AIRA). Asimismo, existen algunos miles de Maestros Independientes por el mundo del linaje de Ntikao Usui.